新疆主要农副产品精深加工工程技术研究中心（以下简称“工程中心”）组建于2012年，并于2016年经自治区科技厅验收批准正式挂牌。依托单位为自治区农业科学院农产品贮藏加工研究所，确立了“粮食作物的精深加工与综合利用技术研究”、“油料及特色农作物精深加工与综合利用技术研究”和“果蔬精深加工与高效利用技术研究”三大核心研发方向。

年均纵向科研经费300万元左右，累计执行各类项目15余项左右，其中牵头国家重点研发计划1项，获得全国农牧渔业丰收一等奖1项、自治区科技进步一等奖2项；发表科研论文10余篇，申请和授权专利20余项；作为自治区农产品加工局技术依托单位（现农业厅农产品加工技术推广中心），提供规划、政策建议、调研服务、培训等工作年均4项次以上，服务企业年均10余家；年培养博士研究生1-2人次，硕士研究生5-10人次。

研发的《果蔬节能提质联合干燥关键技术与装备研制及集成应用》和《新疆特色瓜果贮运加工关键技术创制与集成应用》成果重点在南疆四地州脱贫攻坚和乡村振兴主战场上规模化推广应用，成果辐射新疆13个地州，33个贫困县，从源头解决瓜果出村“最初一公里”和进城“最后一公里”的瓶颈问题，极大地提高了项目成果落地和转化。