新疆维吾尔自治区农业科学院创立于1955年，是自治区人民政府直属的综合性农业科研机构。全院现有11个研究所（实验室）、3个试验站。截至2025年3月底，在职职工1003人，其中，专业技术人员914人。高级职称533人（正高级253人，副高级280人），高级职称占55.1%；有博士251人，硕士419人，研究生学历占66.7%；45岁以下青年科技人员占70%。有中国工程院院士1名，国家级“百千万人才工程”入选5名，“万人计划”科技创新领军人才2名，国家级有突出贡献优秀专家7名，享受国务院政府特殊津贴专家76名，自治区优秀专家51人次。有国家现代农业产业技术体系34人，自治区现代农业产业技术体系107人。

自治区农业科学院紧紧围绕新疆农业发展不同阶段的科技需求，重点培育和构建了作物遗传育种、作物栽培、农业生物技术、植物保护、应用农业微生物、农业资源与生态环境、农业工程与机械装备、设施农业、农业经济与农业系统工程、农业信息技术应用、农产品质量标准、农产品贮藏与加工等区域特色鲜明的重点学科。

建院以来，全院共取得各类科研成果1604项，获奖成果652项，其中省部级二等奖以上奖励270项，审（认）定新品种518个。这些品种和成果的大面积推广应用，为推动我区农业高质量发展、保障粮食安全和重要农产品稳产保供、助力乡村振兴作出了重要贡献。

全院建有国家、部委科技平台47个、自治区科技平台33个，中长期科研基地34个。全院各类平台实验室总面积4万平方米，拥有科研仪器设备7113台（件）、设备总金额3.73亿元，用于试验、示范、良繁的科研用地1.5万亩。

我院先后与40余个国家的科研院校建立了良好合作关系，建设有科技部国际合作基地、自治区引智示范基地、中亚有害生物综合防控技术国际联合研究中心等，积极推动农业科技“走出去”。与国内50余家高水平科研院校开展深层次合作，构建协同创新格局。

进入新发展阶段，自治区农业科学院坚持“创新立院、改革兴院、开放办院、人才强院、品牌亮院”办院方针，聚焦“培育一流特色学科、建立一流科研平台、打造一流科技品牌、建强一流人才队伍、营造一流创新环境、建设一流现代院所”发展目标，积极抢抓机遇，加快构建区域特色鲜明的干旱绿洲农业科研中心、人才中心和创新高地，全面提升我区农业科技创新和产业支撑能力，积极为自治区农业高质量发展贡献科技力量。