近日,自治区农科院果蔬研究所红枣创新团队在《Molecular Horticulture》(IF=10.0)发表了题为“The T2T genome assembly of Ziziphus jujuba 'Huizao' and pan-genome analyses provide insights into fruit texture diversity in jujube”的研究论文。

该研究完成了新疆第一大制干枣品种‘灰枣’的端粒到端粒(T2T)单倍型分型基因组组装,并联合已有的九个枣树基因组数据,采用图形泛基因组策略,构建了枣树泛基因组。研究揭示了枣树品种间极高的基因组多样性,鉴定并表征了GUB_WAK_bind基因家族。分析表明,制干品种‘灰枣’与鲜食品种‘冬枣’之间的分化不仅涉及GUB_WAK_bind基因拷贝数变异,还体现在表达水平与基因组序列差异上,有效解释了两者的表型差异。通过整合基因组、转录组及果实发育数据,研究提出了一个潜在的机制模型:GUB_WAK_bind基因编码的WAKs蛋白响应果胶来源的信号,从而调控果实细胞壁厚度,进而影响果实质地。这些发现为解析GUB_WAK_bind家族的进化及枣果实质地多样性形成的遗传基础提供了新的见解。

自治区农科院果蔬所靳娟副研究员和沈兵琪博士为论文第一作者,樊丁宇研究员和郝庆研究员为论文的共同通讯作者,果蔬研究所为论文第一完成单位。该研究得到了自治区农业科学院农业科技创新稳定支持专项、自治区天山创新团队和国家自然科学基金地区基金项目的资助。