近日，自治区农业科学院果蔬研究所科研团队在《Advanced Science》（IF=14.1）在线发表了题为“eQTL meta-analysis reveals conserved and population-specific regulatory variation underlying nutritional trait evolution and domestication in tomato”的研究论文。该研究通过多组学联合分析，从调控网络层面揭示了番茄营养品质的形成机制，为番茄营养强化和功能性番茄的育种开发提供了重要的理论依据和基因资源天然靶标。
番茄果实的风味受到多种营养代谢物质如可溶性糖酸、胡萝卜素类和挥发性物质等物质的综合影响。通过整合五个遗传背景迥异的番茄群体（涵盖渐渗系、重组自交系及自然群体），开展了迄今规模最大的番茄eQTL Meta分析，共鉴定出40,928个eQTL（其中顺式eQTL 9,463个，反式eQTL 31,465个），关联到12,514个基因。相关研究挖掘到一批保守的和群体特异性的调控位点。MYB12是番茄类黄酮合成通路的关键反式调节因子，同时MYB、HSF、F-box、GRAS等转录因子以及乙烯、赤霉素也可能参与该通路的调控，同时发现MYB12也是番茄叶酸的关键反式调节因子。在类胡萝卜素合成方面，鉴定出Z-ISO、ZDS、CrtISO等关键顺式调控靶点，其与番茄红素、β-胡萝卜素含量显著相关。此外，在糖、酸、叶酸通路中发现了携带错义突变等高影响变异的顺式eQTL，为营养强化及功能性番茄育种提供了天然分子靶标。
自治区农业科学院果蔬研究所赵建涛研究员和华中农业大学园艺林学学院王昕教授为共同第一作者，美国康奈尔大学博伊斯汤姆逊研究所费章君（Zhangjun Fei）为通讯作者。研究得到了旱区农业新疆研究院农业科技创新专项和自治区“天山英才”培养计划等项目的资助。
