新疆维吾尔自治区农业科学院果蔬研究所（国家果树种质资源轮台果树资源圃）（以下简称果蔬所）由原园艺作物研究所、原哈密瓜中心和原轮台果树资源圃于2024年5月合并组建而成。主要开展果树种质资源收集、鉴定、评价、创新与利用研究，开展瓜果、蔬菜、花卉新品种的选育、引进、示范推广和栽培技术研究以及相关成果转化和技术服务。

目前全所职工82人，其中科技人员74人，设有番茄、辣椒、蔬菜栽培、葡萄、苹果、梨、红枣、核桃、扁桃、杏、哈密瓜等12个果蔬创新团队。现有国家级人才1人，国家农业产业技术体系岗站专家7人，自治区突出贡献专家、天山领军人才、自治区农业产业技术体系岗站专家、自治区重点人才计划入选者等专家人才32人。建有国家种质资源库轮台果树种质资源圃、农业农村部新疆地区果树科学观测实验站、新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室等国家和省部级平台10个。

基础研究“多点开花”。在茄属番茄组基因组演化、番茄耐盐机制、果树耐寒机理、葡萄面源污染物积累等研究方面取得重大进展，近3年在Nature Genetics、PLoS Genetics、Plant Biotechnology Journal、Journal of Hazardous Materials、Horticulture Research园艺学报等国际和国内期刊发表论文125篇。

科技支撑“枝繁叶茂”。“新红49号”加工番茄入选农业农村部农业主导品种，核桃密植改造技术入选科技部技术成果汇编，甜瓜机械化栽培技术入选农业农村部主推技术，温室蔬菜立体间套种、果园简约化栽培等技术入选自治区农业主推技术，新品种和栽培技术累计示范推广面积近400万亩。近5年获国家科技进步奖1项、自治区科技进步奖5项，选育和审（认）定新品种8个，授权专利及软件著作权34件，制（修）订行业标准和地方标准42项，出版著作5部。

产业服务“成果丰硕”。科研转化产品“葡萄促干剂”市场占有率超过75%，年销售2000余万元。加工番茄品种权转让收入近500万元。主导喀什地区昆仑仙果产业研究院、英吉沙县杏产业研究院、麦盖提县红枣产业研究院等建设工作，服务林果企业20余家，打造了红枣产业科技创新示范、万亩戈壁现代苹果产业基地等多个产业样板。