该重点实验室属于农业部“十二五”建设的30个学科群中“作物有害生物综合治理学科群”的15个专业性（区域性）重点实验室之一。2011年经农业部批准实施，新疆农科院植保所为建设依托单位。重点实验室针对新疆农林生态区优势农作物、特色林果和设施重大有害生物发生与危害特点，重点开展农林重大有害生物成灾机制及防控技术研究与集成；农林病虫害生物防治及田间应用技术研究，外来农业有害生物预警及防控技术研究，转基因农作物安全评价与抗性治理等。为适宜西北干旱荒漠绿洲生态区的植保新技术、新产品试验和示范提供设施条件良好的基地；为提升西北荒漠绿洲生态区农作物有害生物综合防治技术的创新和成果转化能力提供科技与人才支撑。
