近日，自治区农业科学院生物育种实验室基因组与人工智能创新团队在《Plants》（IF=4.1，JCR Q1）在线发表了题为“Genome-Wide Characterization of Long Non-Coding RNAs Identifies Candidate Regulatory Networks During Modern Maize Breeding”的研究论文。该研究系统鉴定了中国不同育种年代玉米自交系中的lncRNA，发现现代与早期材料间存在大量差异表达lncRNA。研究预测这些lncRNA可能通过调控蛋白编码基因、激素信号通路及ceRNA网络参与玉米株型等农艺性状形成，并初步验证了部分lncRNA对ZmPIF5.2启动子的抑制作用，为玉米分子育种和功能研究提供了候选资源。

本研究基于中国不同育种时期137个玉米自交系的转录组数据，系统鉴定了18,023个lncRNA转录本，并发现现代与早期种质间存在2,228个差异表达lncRNA。通过WGCNA、顺式靶基因预测和ceRNA网络分析，筛选出一批可能参与玉米株型、激素信号转导、形态发生及胁迫响应等过程的候选lncRNA及其调控关联。双荧光素酶实验初步验证了lncrna.33063和lncrna.33068可抑制ZmPIF5.2启动子活性。该研究为解析lncRNA在玉米农艺性状形成和现代育种中的潜在作用提供了重要候选资源和理论基础。

自治区农业科学院生物育种实验室王忠宇为该论文第一作者，李宁和李长育副研究员为共同通讯作者。该研究得到了自治区天池英才“青年博士”项目、自治区自然基金杰出青年项目、国家自然科学基金地区项目以及自治区农业科学院稳定支持项目的资助。