新疆小麦良种产业工程技术研究中心，主管单位: 新疆维吾尔自治区农业科学院。成立时间:2015年6月10日，挂牌时间:2016年3月29日。批准研究方向：小麦高产、优质和稳产新品种关键基因挖掘，解析小麦高产、优质和抗逆的分子遗传机制和调控网络，建立新型高效育种技术体系，培育高产、抗逆、优质小麦新品种及新品种制种、繁种、推广示范工作。拥有试验基地4个，试验基地可支配试验田1580亩，人工气候室、品质测定、分子实验室、资源贮藏室、农机、生产物资储备库等，面积合计1070.5m²。现有仪器设备情况拥有仪器设备95台套。

工程中心现有现有专业技术人员19人，其中研究员5人，中级职称以上人员13人，硕士13人，博士2人。主要科研带头人：李建疆，二级研究员。2024年获批项目4项，到位经费1275万元。发表论文24篇、论著6部；授权国家发明专利授权2项；植物新品种保护权9项，获得实用新型专利6项，申请小麦品种16个，获得转化资金400余万元；审定品种得到新疆小麦区认可，年推广面积在560万亩以上。制定自治区地方标准7项；成果登记5项；2020年《优质绿色高效小麦品种、制种、栽培技术集成及应用》获得新疆维吾尔自治区科技进步二等奖。